Rok a půl poté, co The Mars Volta vydali koncepční Frances the Mute, vyjde na GSL jejich další album. Amputechture vládne osmi skladbami v délce téměř osmdesáti minut, produkcí Omara Rodrigueze a mixem Rich Costeyho (producent posledních Muse nebo Franz Ferdinand). Desku natočili částečně doma v El Pasu, v Los Angeles a australském Melbourne. Na přebalu najdete horizontálně převrácený výřez z obrazu Big Mutant kvazisurrealisty Jeffa Jordana. Mezi hosty se objeví mj. i John Frusciante z Red Hot Chili Peppers, a to v každé z osmi písní. Na konci léta vyrazí obě kapely na společné americké turné.